稀有鱼的刷新与平原、时间、装备和鱼饵相关，在地球的夜灵平原，稀有鱼的出现主要取决于昼夜周期和具体水域。例如鲨客和卡其那这类稀有鱼可以在海岸边找到，捕获它们需要使用黄昏鱼饵，鱼叉可以选择兰佐。而阴暗鳐同样分布在海岸区域，但需要使用专门的阴暗鳐鱼饵和兰佐鱼叉。另一种稀有鱼克苏尔，则只会在夜间的池塘水面出没，需要克苏尔鱼饵和兰佐鱼叉。而只在夜间海岸边出现的盖拉佩德，是需求条件较高的鱼种，需要盖拉佩德鱼饵和佩拉姆鱼叉。

此外像冥肺鱼这样的鱼类，会在夜晚于平原的湖泊或池塘中刷新，例如在琉璃湖东边的池塘就是一个不错的钓点。在金星平原钓鱼的机制有所不同，鱼类的出现与水温状态关联密切。传感鱼是一种稀有鱼，它只会在洞穴内的热点水域中出现。而创生鱼也同样分布在洞穴的热点水池中，捕获后分解可以获得萨根模块。

火卫二的魔胎之境环境更为独特，其稀有鱼的出没受Fass-Vome周期的影响很大。水肺仅在Vome时段的外分泌液热点中出现，璃化脊鳎也只在Vome时段活跃于地表池塘。三尾额叶鲤在Fass时段的高浓度外分泌液，须腔棘鱼在Vome时段的溪流中活动。在洞穴中独角米索鳎栖息于地下区域的暗水潭里，骨锥琼鲷在所有洞穴水体中均可能刷新，但在腐蚀洞穴的出现率较高，狍鸮胶蛳则仅在Fass周期的红光阶段活跃于洞穴入口附近的气泡水域。

在前往钓点前准备好对应的特制鱼叉和专用鱼饵，使用光亮染料可以提高昏暗水域的能见度。在目标区域可以先用扫描器侦察水体，发现稀有鱼信号后标记位置，对付一些稀有鱼，使用它们偏好的诱饵可以提升出现概率。